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Gene Protein Transcript Promoter Expression GO/PPI PubMed Cross reference

Gene information for TBP (Homo sapiens) (Information is obtained from NCBI Gene database)

Entrez gene ID 6908 Official gene symbol TBP Full name TATA box binding protein Aliases ,GTF2D,GTF2D1,MGC117320,MGC126054,MGC126055,SCA17,TFIID, Gene summary Initiation of transcription by RNA polymerase II requires the activities of more than 70 polypeptides. The protein that coordinates these activities is transcription factor IID (TFIID), which binds to the core promoter to position the polymerase properly, serves as the scaffold for assembly of the remainder of the transcription complex, and acts as a channel for regulatory signals. TFIID is composed of the TATA-binding protein (TBP) and a group of evolutionarily conserved proteins known as TBP-associated factors or TAFs. TAFs may participate in basal transcription, serve as coactivators, function in promoter recognition or modify general transcription factors (GTFs) to facilitate complex assembly and transcription initiation. This gene encodes TBP, the TATA-binding protein. A distinctive feature of TBP is a long string of glutamines in the N-terminus. This region of the protein modulates the DNA binding activity of the C terminus, and modulation of DNA binding affects the rate of transcription complex formation and initiation of transcription. The number of CAG repeats encoding the polyglutamine tract is usually 32-39, and expansion of the number of repeats increases the length of the polyglutamine string and is associated with spinocerebellar ataxia 17, a neurodegenerative disorder classified as a polyglutamine disease. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq] Location Chromosome: 6   Locus: 6q27 Gene position 170863421 - 170881958  Map Viewer Gene orientation plus Gene size 18538 bp Gene sequence >TBP:75032878..75051415:Length=18538 GGCGGAAGTGACATTATCAACGCGCGCCAGGGGTTCAGTGAGGTCGGGCAGGTTCGCTGT GGCGGGCGCCTGGGCCGCCGGCTGTTTAACTTCGCTTCCGCTGGCCCATAGTGATCTTTG CAGTGACCCAGGTAACAGATTGTACTCTTTTCTGACGGTTCGGGCGAAGGCCACCACTGC ACTGAGGCCTGGGGGCAATGGTGGGGAAGAGACTAGGAATTGGCGCGCGTGCAGGCCCCT CGGGGGACGTTCCTCCCTTTCGTGCTGCCGCCGTTCCGGCCTGTAACGGCCACTCGGCCG CCACTCCCGCCTGGTGCCCTACTCTGCTGTGTTTCGCAGGCAGCTTCCCATCGTACGATT GTGGGGCTCAGGGTACTACTGGCTGGCTGGGCGGCGGCAGGCGGGACAGGACAGTCCCTT GCATCGAAGACCCTAAGTTTACCCTGCCCTGTCCTGCCATCCGCTTCTTCTCCATGTTAG AAGCAGATTCACCCAGATCTGTGCCCGCCTGTTTTGCTGCCAACATTGAGACTTAAATAT TTTGTCAGAAGCCTGAGACAGCGGGCACGGTAGCGCTTAAGATATAATACACACCACTTT ATTTGCAGGGTCTCCCGTCTCTCGGTTCAGGCCATCATGGTTTTCCAAATCTCTAGGTAG ACTTTTCTGTGAAAAGACTGTGCTTCATTTAGTTATACAGACACTAGAAGGCTATGCAGA ATTAATTTGATTGCCTCCAAAAAATATCGGATTTGATGTTTCAATTTCCAGGAGATGAAG 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