TransSpProbes

Home

FAQs

Post question

Process data

Gene

Protein

Transcript

Blast result

Transcript specific probe-cluster

For Human genome U133 plus 2 array
[RefSeq ID: NM_001001.3 (Number of probes = 11)]

Probe-cluster	Co-ordinates
Probe-cluster	X	Y
209297_at	943	965
	281	823
	438	629
	20	501
	634	751
	629	1121
	695	125
	390	917
	669	547
	1014	1047
	404	1067
209298_s_at	815	15
	79	1053
	728	867
	598	163
	14	241
	1127	437
	1114	1079
	727	1127
	550	521
	1140	751
	258	151
217256_x_at	434	133
207585_s_at	1115	529
	912	663
	1046	723
	530	87
	922	775
	191	659
	923	531
	812	351
	264	563
	36	487
	213	695
226608_at	274	259
	692	517
	288	1139
	919	849
	780	693
	103	519
	729	1045
	496	23
	480	1101
	525	771
	338	1075
1569469_a_at	552	21
	396	1159
	133	249
	1074	27
	993	189
	591	17
	301	571
	28	713
	83	33
	582	593
	35	721
235016_at	965	605
	1097	457
	878	1093
	320	299
	1005	1033
	304	53
	501	109
	743	195
	522	379
	1127	741
	391	187
225785_at	801	45
	771	1043
	505	623
	929	235
	188	1041
	588	193
	773	219
	38	567
	555	1143
	201	375
	1059	711
211018_at	457	99
	833	967
	22	643
	302	859
	1050	565
	344	345
	461	459
	631	801
	238	343
	474	775
	795	1161
35776_at	844	1045
	543	759
	172	777
	383	813
	823	365
	898	1027
	943	1045
	799	183
	38	655
	699	909
	760	1003
	384	725
	816	785
	924	759
	550	405
	958	755

For Human genome U133 A 2 array
[RefSeq ID: NM_001001.3 (Number of probes = 38)]

Probe-cluster	Co-ordinates
Probe-cluster	X	Y
209297_at	663	377
	37	295
	391	549
	368	639
	708	489
	208	331
	203	669
	623	69
	178	629
	636	449
	667	577
209298_s_at	316	449
	67	269
	540	629
	248	645
	140	517
	25	93
	202	59
	536	313
	203	11
	78	671
	12	133
217256_x_at	58	75
207585_s_at	110	289
	477	581
	230	421
	704	337
	618	399
	526	319
	719	197
	180	397
	315	417
	25	51
	614	463
211018_at	69	55
	353	475
	18	341
	488	385
	240	271
	548	463
	312	679
	572	513
	360	193
	170	579
	422	195
35776_at	505	391
	357	627
	638	617
	664	453
	271	385
	640	461
	119	629
	281	103
	622	601
	410	467
	526	451
	671	207
	353	453
	373	231
	464	543
	272	485

For Human genome U133 A array
[RefSeq ID: NM_001001.3 (Number of probes = 38)]

Probe-cluster	Co-ordinates
Probe-cluster	X	Y
209297_at	305	507
	539	659
	215	71
	143	649
	560	593
	10	567
	80	341
	90	465
	557	687
	373	305
	164	391
209298_s_at	174	667
	329	85
	636	245
	14	535
	385	11
	139	691
	643	323
	604	93
	91	135
	561	649
	600	463
207585_s_at	308	477
	199	409
	339	447
	39	413
	487	349
	554	329
	298	429
	395	263
	498	203
	645	49
	20	301
217256_x_at	86	77
211018_at	515	477
	13	57
	17	201
	430	277
	289	399
	377	529
	288	199
	562	351
	159	599
	447	709
	430	493
35776_at	20	637
	333	621
	327	405
	654	239
	189	561
	68	105
	28	501
	352	477
	258	481
	12	215
	334	645
	431	467
	113	451
	272	465
	35	469
	422	641

For Human genome U133 B array
[RefSeq ID: NM_001001.3 (Number of probes = 11)]

Probe-cluster	Co-ordinates
Probe-cluster	X	Y
226608_at	156	665
	368	311
	16	147
	584	657
	398	473
	76	423
	106	639
	466	521
	542	695
	287	17
	297	313
235016_at	53	369
	126	275
	196	35
	399	113
	495	455
	624	227
	398	109
	363	633
	586	175
	515	65
	238	671
225785_at	516	699
	327	637
	326	219
	364	377
	609	111
	423	129
	426	435
	327	29
	569	343
	631	637
	505	139

For Human genome U95 Av2 array
[RefSeq ID: NM_001001.3 (Number of probes = 25)]

Probe-cluster	Co-ordinates
Probe-cluster	X	Y
39107_at	532	547
	257	183
	335	163
	59	283
	443	21
	122	247
	165	251
	203	219
	126	397
	159	317
	199	271
39856_at	523	323
	536	297
	532	531
	617	513
	530	295
	503	361
	535	297
	598	541
	285	475
	386	635
	597	291
	296	523
	223	617
	502	361
	407	429
	246	499
35776_at	333	499
	500	191
	584	569
	413	555
	439	555
	88	579
	399	403
	634	181
	293	399
	246	561
	591	147
	87	579
	184	631
	483	313
	300	521
	574	339
488_at	482	371
	608	489
	637	485
	449	577
	425	609
	400	509
	560	629
	185	613
	212	503

For Human genome U95 B array
[RefSeq ID: NM_001001.3 (Number of probes = 16)]

Probe-cluster	Co-ordinates
Probe-cluster	X	Y
47074_at	314	491
	231	535
	580	275
	413	505
	609	227
	574	439
	431	403
	205	555
	375	579
	545	581
	488	321
	492	323
	204	555
	507	421
	630	175
	489	321

For Human genome U95 C array
[RefSeq ID: NM_001001.3 (Number of probes = 0)]

No transcript specific probes found

For Human genome U95 D array
[RefSeq ID: NM_001001.3 (Number of probes = 0)]

No transcript specific probes found

For Human genome U95 E array
[RefSeq ID: NM_001001.3 (Number of probes = 43)]

Probe-cluster	Co-ordinates
Probe-cluster	X	Y
81594_at	539	97
	317	449
	307	637
	357	439
	409	525
	472	263
	538	173
	502	251
	568	173
	403	235
	341	275
	526	89
	189	427
77611_at	520	63
	311	231
	281	181
	73	451
	176	417
	396	161
	184	443
	506	87
	179	313
	189	407
	395	105
	574	629
	252	293
	548	377
	568	197
	584	277
71844_at	11	311
	210	199
	163	457
	392	43
	355	183
	29	387
	411	9
	107	361
	320	341
	391	411
	378	79
	115	321
	222	101
	59	369
	87	321
	13	363
75437_at	206	315
	207	315
	208	117
	470	147
	318	17
	169	457
	54	387
	497	463
	108	323
	86	157
	270	113
	65	49
	496	463
	379	23

For Human genome focus array
[RefSeq ID: NM_001001.3 (Number of probes = 16)]

Probe-cluster	Co-ordinates
Probe-cluster	X	Y
207585_s_at	154	261
	385	35
	245	297
	18	257
	430	283
	200	193
	80	211
	52	133
	440	271
	306	221
	210	185
35776_at	430	147
	26	293
	222	297
	11	155
	352	305
	194	407
	153	393
	315	355
	107	281
	232	303
	165	137
	268	69
	424	315
	73	401
	68	409
	127	259

For HT Human genome U133 plus PM array
[RefSeq ID: NM_001001.3 (Number of probes = 18)]

Probe-cluster	Co-ordinates
Probe-cluster	X	Y
1569469_PM_a_at	142	582
	578	715
	77	402
	203	18
	654	417
	158	346
	657	334
	389	494
	467	56
211018_PM_at	656	186
	516	703
	439	527
	438	684
	44	657
	214	172
	699	587
	631	382
	150	496
209297_PM_at	584	439
	393	470
	164	194
	298	619
	37	97
	381	601
	175	442
	637	717
	204	127
209298_PM_s_at	317	199
	281	721
	134	435
	642	393
	209	292
	595	131
	478	175
	472	648
	678	210
207585_PM_s_at	5	654
	291	701
	681	483
	408	560
	423	612
	689	37
	515	491
	741	576
	202	396
	305	22
	179	156

For HT human genome U133A array
[RefSeq ID: NM_001001.3 (Number of probes = 38)]

Probe-cluster	Co-ordinates
Probe-cluster	X	Y
209297_at	38	625
	321	417
	639	491
	179	95
	660	535
	349	601
	711	335
	469	723
	660	681
	655	685
	292	363
209298_s_at	620	23
	411	71
	654	683
	44	343
	619	729
	561	561
	380	117
	398	259
	8	159
	193	697
	707	493
217256_x_at	77	99
207585_s_at	219	459
	547	75
	71	329
	506	439
	133	239
	729	455
	698	377
	649	503
	256	355
	666	439
	60	229
211018_at	61	381
	265	503
	215	81
	719	681
	75	561
	213	431
	123	221
	695	225
	600	625
	704	303
	553	523
35776_at	218	267
	113	499
	567	143
	265	237
	42	499
	236	655
	624	663
	122	437
	81	683
	672	489
	294	529
	522	471
	253	125
	602	591
	524	497
	57	507

For HT human genome U133B array
[RefSeq ID: NM_001001.3 (Number of probes = 11)]

Probe-cluster	Co-ordinates
Probe-cluster	X	Y
226608_at	412	526
	668	644
	314	314
	114	426
	118	16
	173	146
	467	662
	658	478
	319	314
	706	686
	671	670
235016_at	130	178
	136	372
	672	672
	636	66
	191	110
	259	228
	582	114
	163	34
	672	458
	369	278
	539	638
225785_at	66	384
	367	344
	60	30
	329	642
	51	710
	412	128
	399	440
	515	112
	274	222
	647	640
	294	138

For U133 X3P array
[RefSeq ID: NM_001001.3 (Number of probes = 11)]

Probe-cluster	Co-ordinates
Probe-cluster	X	Y
probe:U133_X3P:g1019365_3p_at	1092	1007
	306	127
	410	3
	758	127
	287	217
	498	351
	359	947
	460	613
	50	1107
	520	101
	855	651
probe:U133_X3P:Hs.121557.0.S1_3p_at	262	337
	447	33
	75	959
	823	563
	676	1097
	148	1083
	642	121
	63	189
	1036	609
	693	671
	52	865
probe:U133_X3P:Hs.279789.9.S1_3p_at	487	493
	126	431
	348	267
	805	315
	452	315
	96	77
	849	1141
	897	403
	786	611
	259	625
	172	723
probe:U133_X3P:g4506650_3p_a_at	100	603
	631	571
	995	827
	190	439
	511	447
	433	719
	73	475
	672	781
	179	807
	1114	669
	346	927
probe:U133_X3P:Hs2.403934.1.S1_3p_a_at	582	31
	842	205
	210	83
	837	37
	379	1121
	303	709
	717	155
	432	579
	885	19
	83	39
	682	897
probe:U133_X3P:Hs.322901.1.S1_3p_at	1059	365
	51	647
	752	35
	391	21
	380	535
	1110	223
	818	1071
	524	1147
	928	683
	75	1061
	333	1031
probe:U133_X3P:g4808824_3p_s_at	717	131
	136	1033
	626	901
	34	515
	279	287
	11	1065
	707	515
	953	949
	775	61
	1086	1099
	608	419