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Gene Protein Transcript Promoter Expression GO/PPI PubMed Cross reference

Gene information for UPF3B (Homo sapiens) (Information is obtained from NCBI Gene database)

Entrez gene ID 65109 Official gene symbol UPF3B Full name UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog B (yeast) Aliases ,HUPF3B,MRXS14,RENT3B,UPF3X, Gene summary This gene encodes a protein that is part of a post-splicing multiprotein complex involved in both mRNA nuclear export and mRNA surveillance. The encoded protein is one of two functional homologs to yeast Upf3p. mRNA surveillance detects exported mRNAs with truncated open reading frames and initiates nonsense-mediated mRNA decay (NMD). When translation ends upstream from the last exon-exon junction, this triggers NMD to degrade mRNAs containing premature stop codons. This protein binds to the mRNA and remains bound after nuclear export, acting as a nucleocytoplasmic shuttling protein. It forms with Y14 a complex that binds specifically 20 nt upstream of exon-exon junctions. This gene is located on the long arm of chromosome X. Two splice variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq] Location Chromosome: X   Locus: Xq25-q26 Gene position 118986991 - 118967989  Map Viewer Gene orientation minus Gene size 19003 bp Gene sequence >UPF3B:complement(3235699..3254701):Length=19003 GCATTTGTTGGGGGCGGAGCTTTGACGGGAGCTTCCCGGGAGCCGTTTGTGCCCGGGGTA ACCCCGTTCCGGCCAAGCCGCTTCAGCGGGGGACGTAGCCATGAAGGAAGAGAAGGAGCA CAGGCCTAAGGAGAAGCGAGTAACCCTGTTAACCCCCGCCGGGGCCACAGGCAGCGGTGG TGGGACCTCGGGGGACAGCTCCAAGGGGGAAGATAAGCAGGATCGCAACAAGGAGAAGAA AGAAGCGCTGAGCAAGGTGCCCGGTCGGCCGCTGGCCCGGGAGAGGGCGGGACGAGTCCG CAGCGCGGGGAGGATGGCTGGGAATGGGGCTGCCCCCTTTCTTTCTCAGGTTCTCCTTCT ATCTCTTCGCCTGAATGGAAGTCGCATCATCCTGGTTCATCCATTCACCCGAAATGGGGA GAGCCCCTCCCGGCCAAATCCTGGGTGGGGGTGAGGAAAAGAGGGGACTCCCCAAACGGG AAGGGTTTAGGTCAGAGCTGTGAGATGATAATGGGAGGGAAGAGCGACGGTATAAAGAAT GAGGAACTAAAGGTGTAATTGGGGAGAAATATTAAATAGTGAAGGAGACATGAGGGATGG GAATATTATTCATGGAGGCGAGTTGGGGGAGAGTGCAGGGTGATTAATGGTACAGGAGGG TAGATCGAGAGCATCCTATTTTGAGAGCAATGGGTAGATTTTTTGTATTCGTTAGAGTTT 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